好氧生物处理时，污水中有机物的转化过程可用图5-6表示。有机物被微生物吸收后，一部分被氧化分解成简单的无机物(有机物中的C和O被转变成C02，H与02化合成H20，N被氧化成NH3或N02-和N03一，P被氧化成P04’磷酸盐，S被氧化成504’等)，同时释放出能量，作为微生物自身生命活动的能源：另一部分则作为微生物生长繁殖所需的构造物质，合成新的生物体。由此可见，经过微生物的好氧代谢，污水中高能位的有机污染物最终以低能位的无机物稳定下来，达到无害化要求，以便返回自然环境或进一步处置。
在好氧生物处理过程中，有机物用于分解与合成代谢的比例随污水中有机物性质而异。对于生活污水或与之相类似的工业废水，被微生物所摄取的有机物，约1/3被分解、稳定，约2/3被转化为新的细胞物质，即进行微生物自身生长繁殖，成为生物处理中活性污泥或生物膜的增长部分，通常称为剩余活性污泥或剩余生物膜，统称剩余生物污泥，经固液分离后被排出处理系统。
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